V aktualizovanom vydaní Prírodného atlasu Slovenska je územie Slovenska rozdelené na jednotlivé mapové listy, na ktorých sú zakreslené najzaujímavejšie prírodné lokality a chránené územia od rozľahlých národných parkov po najmenšie prírodné rezervácie či prírodné pamiatky.
Druhé vydanie Kultúrneho atlasu Slovenska má mierne pozmenené a aktualizované vydanie. Jeho štruktúra vychádza z existencie historicko-geografických regiónov, v ktorých sú zakreslené jednotlivé kultúrno-historické pamiatky. Najvýznamnejšie pamiatky sú zvýraznené červenou farbou, žltá farba označuje mestá a dediny, v ktorých sa nachádzajú.
Atlas nadväzuje na Atlas kultúrnych zaujímavostí Slovenska a tvorí doplnok k vydaným i plánovaným publikáciám z edície Prírodné Krásy Slovenska. Jeho štruktúra je iná ako v prípade Atlasu kultúrnych zaujímavostí Slovenska, pretože jednotlivé ucelené regióny nepredstavuje samostatne, ale je pripravený skôr ako klasický atlas.
