Dvacet let po uvedení prvního filmu do kin přichází pokračování tohoto úspěšného snímku. Mezinárodní společenství se zotavuje a buduje obranu Země pomocí technologií zachráněných při první invazi. Nicméně, cizinci byli schopni před svým konečným zničením vyslat nouzový signál, což vede k příletu nových cizích lodí na Zemi a k opětovnému ohrožení lidské rasy...
Pod Caesarovým vedením si stále početnější národ geneticky vyvinutých opic budoval vlastní domov. Zatímco však uvykaly mírumilovnému způsobu života, lidstvo decimoval strašlivý virus, jenž se aktivoval právě při útěku opic z lidského područí. Ani jedna skupina neví o tom, že druhá přežila – dokud nedojde k násilnému střetu mezi opicemi a skupinkou lidských přeživších. Záhy je uzavřen křehký mír,